屋顶花园漏水是屋顶花园建造中对工程质量和使用效果影响最大的问题之一，造成屋顶花园漏水的主要原因如下。
（1）防水层在施工时存在结构缺陷,导致屋顶花园漏水。
目前建筑防水材料大体上可分为五类，即沥青防水卷材、高分子防水片材、建筑防水涂料、建筑密封材料及防渗堵漏等特种用途的防水材料。可能由于施工单位质量意识不强，致使防水层在施工时出现结构缺陷。材料的选择、设计存在弊端，施工质量的问题都对防水层的性能产生一定的影响。防水层在施工时要注意天气条件，它直接关系到施工质量的问题，尤其是屋顶花园更应该严格把关。而且防水层施工往往要与相关层交叉作业，这些相关层次的施工质量对防水层的质量有很大影响，所以施工时要特别注意。目前施工单位良莠不齐，假冒伪劣产品充斥市场，所以材料检测、施工监理必须严格把关。
（2）施工时防水材料的高度不够,导致屋顶花园漏水。
防水材料在施工时的高度应该与周围建筑物的性能、质量和使用功能协调搭配，满足建筑物的防水要求。如果高度达不到要求，防水层中留有施工遗留水分和吸收空气中的水分，经过风吹日晒，防水层老化加快，导致防水层破坏。
（3）建造屋顶花园时防水层的结构被破坏,导致屋顶花园漏水。
在防水层建设施工时，施工单位的施工质量意识不强，使用质检不合格的防水材料，会减少防水层的寿命，在防水层施工时也容易受到破坏。
（4）屋顶花园的水体增加了屋顶花园中的水源，,导致屋顶花园漏水。
在屋顶花园建造完成后，浇灌植物用水、水池、喷泉等水体使用极为频繁，使屋顶增加了漏水的水源。如果建筑排水设施不畅，会造成积水而使屋顶花园漏水。
（5）种植植物时，种植工具对防水层有一定的破坏,导致屋顶花园漏水。
在屋顶花园种植植物时由于种植工具锐利，容易把防水层戳坏，比如填土时用的铲子有可能破坏泛水边缘的防水层。
（6）穿透性强的植物的根对防水层有一定的破坏性,导致屋顶花园漏水。
有些植物的根穿透性极强，对防水层有一定的破坏性。
（7）屋顶花园的排水设施不当，会引起屋顶积水,导致屋顶花园漏水。
屋顶花园应有良好的排水设施。排水设施可用来改善种植基质的通气状况，排除多余的水分，缓解积水过多给屋顶造成的压力。大雨过后，屋顶的水分若不及时排出，积聚在屋顶，久而久之因长时间受水侵泡而使防水层受到破坏，减少寿命。
（8）经过长期的风吹日晒、风化作用等，使防水层的材料老化，,导致屋顶花园漏水。再加上施工时受到一定的破坏，引起屋顶花园漏水。
（9）业主对屋顶花园的保护意识不强,导致屋顶花园漏水。
在屋顶花园设计装修时，要比平地上的要求严格得多，需要注意建设施工时的细枝末节。在屋顶花园建成后业主对其保护意识要比平地上的建设有过之而无不及，才能使屋顶花园更好、更方便、更长久地为人们提供服务。
